Особливості поліморфізму генів одновуглецевого метаболізму серед населення Європи

Abstract

Актуальність. Поліморфні варіанти генів фолатного обміну пов’язані з ризиком розвитку серцево-судинних, нейродегенеративних, ендокринних, дерматологічних захворювань, репродукційних порушень, вроджених вад розвитку, новоутворень тощо (Chen et al., 2012; Liew, Gupta, 2015). В той же час асоціації між генотипами та захворюваннями можуть бути неоднаковими у різних країнах. Тому вивчення особливостей алельного поліморфізму за генами одновуглецевого метаболізму у кожній державі окремо є актуальним. Мета роботи: аналіз зв’язку розподілу частот генотипів та алелів за генами MTHFR, MTR та MTRR з показниками широтної зональності у Європі. Матеріали та методи. Проаналізовано літературні дані щодо частот генотипів та алелів за поліморфними варіантами С677Т та А1298С гена MTHFR, A2756G гена MTR та A66G гена MTRR, а також зумовленого ними рівня гомоцистеїну у плазмі крові 15881 особи з 9 європейських країн — Австрії, Великої Британії, Данії, Ірландії, Італії, Німеччини, Польщі, Франції та Хорватії (Bethke et al., 2008; Botto, Yang, 2000; Kloss et al., 2006; Kokotas et al., 2009; Kurzwelly et al., 2010; Relton et al., 2004; Seremak-Mrozikiewicz et al., 2013; Yu et al., 2004). Перевірку даних на відповідність закону Гаусса виконано за критерієм Шапіро-Уїлка. Зв’язок між показниками визначено за допомогою кореляційного аналізу за Пірсоном та Спірменом. Результати. Вивчення географічних особливостей розподілу частот алелів та генотипів за однонуклеотидними поліморфізмами генів фолатного обміну у європейських країнах виявило зростання частот генотипів 677CT, 66AG та алеля 677Т з півночі на південь, встановлено негативний зв’язок між показниками широтної зональності та частотами генотипів 677CT (r=-0,721, p=0,019), 66AG (r=-0,652, p=0,041) та алеля 677Т (r=-0,648, p=0,043). Співставлення кількісних характеристик алелів та генотипів досліджуваних поліморфних варіантів серед населення європейських країн з рівнями гомоцистеїну у плазмі крові жителів, наведеними у літературі, виявило позитивний зв’язок між частотами алеля 2756А та генотипу 2756АА з підвищенням концентрації цієї амінокислоти (r=0,689, p=0,040 та r=0,751, p=0,020). Частоти алеля 2756G та генотипу 2756GG мали негативний зв’язок з підвищенням рівня гомоцистеїну у плазмі крові (r=-0,737, p=0,024 та r=-0,771, p=0,015). Висновки. Визначено негативний зв’язок між показниками географічної широти та частотами генотипів MTHFR 677CT, MTRR 66AG і алеля MTHFR 677Т.