Комплекс «Музей медицини» Харківського національного медичного університету створено 1 березня 2025 р. шляхом реорганізації Музею історії ХНМУ та приєднання до нього зібрань та колекцій 8 кафедр університету. Колекції Комплексу розміщені в центральній залі музею, а також на кафедрах анатомії людини; клінічної анатомії та оперативної хірургії; громадського здоров’я та управління охороною здоров’я; епідеміології; загальної та клінічної патологічної фізіології ім. Д.О. Альперна; мікробіології, вірусології та імунології ім. проф. Д.П. Гриньова; патологічної анатомії; фармакології та медичної рецептури.